Całokształtem działalności wewnątrz Spółki kieruje Prezes Zarządu. Umowę o pracę z Prezesem Zarządu zawiera Przewodniczący Rady Nadzorczej. Stosunek pracy ze wszystkimi pozostałymi pracownikami Spółki nawiązuje i rozwiązuje Zarząd Spółki. Strukturę organizacyjną PUK w Chojnie Sp. z o.o. tworzą jednostki organizacyjne – Działy.
Działy podlegają bezpośrednio Prezesowi Zarządu.
Działami kierują kierownicy.